Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms