Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms