Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms