Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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