Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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