Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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