Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms