Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF5Q13568 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms