Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC13A2Q13183 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms