Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms