Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRKAA2P54646 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRKAA2P54646 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms