Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms