Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK8P49336 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK8P49336 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK8P49336 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK8P49336 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms