Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDF5P43026 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms