Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms