Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVH48-1M5A8F1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVH48-1M5A8F1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVH48-1M5A8F1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVH48-1M5A8F1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms