Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSDA5PKW4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms