Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF6Q9Y4K3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms