Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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COPS7AQ9UBW8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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COPS7AQ9UBW8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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COPS7AQ9UBW8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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