Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCDC180Q9P1Z9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC180Q9P1Z9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms