Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms