Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms