Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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