Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms