Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMM29Q9BSF4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms