Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM79Q9BSE2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms