Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms