Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHFRQ96EP1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms