Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF34Q969K3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF34Q969K3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms