Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms