Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT2Q6NUI2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GPAT2Q6NUI2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms