Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT3Q5FWE3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms