Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms