Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms