Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FXNQ16595 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FXNQ16595 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FXNQ16595 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms