Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP4Q15650 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms