Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms