Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB1Q14028 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB1Q14028 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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