Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM2Q13029 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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