Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN1Q12860 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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