Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK18Q07002 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms