Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHRNEQ04844 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms