Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK3Q00526 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms