Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAT1AQ00266 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAT1AQ00266 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms