Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63132 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms