Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NME5P56597 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NME5P56597 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NME5P56597 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms