Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA2P51531 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SMARCA2P51531 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA2P51531 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA2P51531 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms