Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms