Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms