Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRPRAP08240 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRPRAP08240 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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